Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KLHDC9Q8NEP7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms