Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3C3Q8NEB9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms