Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF248Q8NDW4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145 ms