Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BBOF1Q8ND07 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBOF1Q8ND07 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms