Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF169Q8NCN4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF169Q8NCN4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
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