Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP38Q8NB14 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP38Q8NB14 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms