Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U9

BMPER, BMP-binding endothelial regulator protein, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMPERQ8N8U9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMPERQ8N8U9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BMPERQ8N8U9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BMPERQ8N8U9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms