Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00337Q8N6G1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms