Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN19Q8N6F1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN19Q8N6F1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
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