Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SVOPQ8N4V2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms