Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1N4

KRT78, Keratin, type II cytoskeletal 78, humanhuman

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT78Q8N1N4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT78Q8N1N4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT78Q8N1N4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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