Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN4BQ8IWT1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN4BQ8IWT1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN4BQ8IWT1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN4BQ8IWT1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN4BQ8IWT1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN4BQ8IWT1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms