Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP5

FUNDC1, FUN14 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC1Q8IVP5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FUNDC1Q8IVP5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FUNDC1Q8IVP5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms