Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC71Q8IV32 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms