Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUD6

RNF135, E3 ubiquitin-protein ligase RNF135, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF135Q8IUD6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF135Q8IUD6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF135Q8IUD6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF135Q8IUD6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF135Q8IUD6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF135Q8IUD6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF135Q8IUD6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF135Q8IUD6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF135Q8IUD6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF135Q8IUD6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF135Q8IUD6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF135Q8IUD6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF135Q8IUD6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF135Q8IUD6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF135Q8IUD6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF135Q8IUD6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF135Q8IUD6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF135Q8IUD6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF135Q8IUD6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF135Q8IUD6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF135Q8IUD6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF135Q8IUD6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF135Q8IUD6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF135Q8IUD6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF135Q8IUD6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF135Q8IUD6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF135Q8IUD6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF135Q8IUD6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF135Q8IUD6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF135Q8IUD6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF135Q8IUD6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF135Q8IUD6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms