Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD3

TMEM25, Transmembrane protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM25Q86YD3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM25Q86YD3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM25Q86YD3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM25Q86YD3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms