Protein–RNA interactions for Protein: Q86V35

CABP7, Calcium-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP7Q86V35 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CABP7Q86V35 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CABP7Q86V35 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CABP7Q86V35 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CABP7Q86V35 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CABP7Q86V35 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CABP7Q86V35 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CABP7Q86V35 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CABP7Q86V35 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP7Q86V35 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP7Q86V35 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP7Q86V35 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP7Q86V35 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP7Q86V35 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP7Q86V35 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP7Q86V35 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP7Q86V35 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP7Q86V35 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP7Q86V35 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP7Q86V35 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP7Q86V35 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP7Q86V35 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CABP7Q86V35 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP7Q86V35 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms