Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD3Q86UT5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms