Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4N2

TRPM1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM1Q7Z4N2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRPM1Q7Z4N2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRPM1Q7Z4N2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRPM1Q7Z4N2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRPM1Q7Z4N2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRPM1Q7Z4N2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRPM1Q7Z4N2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRPM1Q7Z4N2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRPM1Q7Z4N2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRPM1Q7Z4N2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRPM1Q7Z4N2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRPM1Q7Z4N2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRPM1Q7Z4N2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRPM1Q7Z4N2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRPM1Q7Z4N2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRPM1Q7Z4N2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRPM1Q7Z4N2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRPM1Q7Z4N2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRPM1Q7Z4N2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms