Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RD3Q7Z3Z2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RD3Q7Z3Z2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms