Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3E5

ARMC9, LisH domain-containing protein ARMC9, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC9Q7Z3E5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARMC9Q7Z3E5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ARMC9Q7Z3E5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARMC9Q7Z3E5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms