Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF550Q7Z398 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms