Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTF1AQ7RTS3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTF1AQ7RTS3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTF1AQ7RTS3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTF1AQ7RTS3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTF1AQ7RTS3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTF1AQ7RTS3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTF1AQ7RTS3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTF1AQ7RTS3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTF1AQ7RTS3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTF1AQ7RTS3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTF1AQ7RTS3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTF1AQ7RTS3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
PTF1AQ7RTS3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms