Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZD4Q76G19 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZD4Q76G19 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms