Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM47EQ6ZV65 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM47EQ6ZV65 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms