Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf47Q6ZRZ4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms