Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM136Q6ZRR5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms