Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMV7

LEKR1, Leucine-, glutamate- and lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEKR1Q6ZMV7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LEKR1Q6ZMV7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LEKR1Q6ZMV7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms