Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDZRN4Q6ZMN7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZRN4Q6ZMN7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms