Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACD2Q6Y1H2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms