Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PACS1Q6VY07 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PACS1Q6VY07 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PACS1Q6VY07 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PACS1Q6VY07 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PACS1Q6VY07 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PACS1Q6VY07 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms