Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms