Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SHC4Q6S5L8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms