Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF549Q6P9A3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF549Q6P9A3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF549Q6P9A3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF549Q6P9A3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF549Q6P9A3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF549Q6P9A3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms