Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ANKRD54Q6NXT1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms