Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGMBQ6NW40 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGMBQ6NW40 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGMBQ6NW40 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
RGMBQ6NW40 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGMBQ6NW40 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGMBQ6NW40 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGMBQ6NW40 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms