Protein–RNA interactions for Protein: Q6J4K2

SLC8B1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, humanhuman

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Length 584 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1Q6J4K2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC8B1Q6J4K2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC8B1Q6J4K2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC8B1Q6J4K2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
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