Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCSAPQ6IQ19 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCSAPQ6IQ19 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCSAPQ6IQ19 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
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