Protein–RNA interactions for Protein: Q6H8Q1

ABLIM2, Actin-binding LIM protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM2Q6H8Q1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABLIM2Q6H8Q1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABLIM2Q6H8Q1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABLIM2Q6H8Q1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms