Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD5Q6GMV2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD5Q6GMV2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMYD5Q6GMV2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms