Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATL3Q6DD88 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATL3Q6DD88 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATL3Q6DD88 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATL3Q6DD88 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATL3Q6DD88 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATL3Q6DD88 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATL3Q6DD88 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATL3Q6DD88 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATL3Q6DD88 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATL3Q6DD88 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATL3Q6DD88 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATL3Q6DD88 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATL3Q6DD88 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATL3Q6DD88 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATL3Q6DD88 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATL3Q6DD88 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATL3Q6DD88 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATL3Q6DD88 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATL3Q6DD88 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATL3Q6DD88 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATL3Q6DD88 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATL3Q6DD88 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATL3Q6DD88 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATL3Q6DD88 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATL3Q6DD88 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATL3Q6DD88 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATL3Q6DD88 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATL3Q6DD88 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATL3Q6DD88 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms