Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC8Q6A555 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNDC8Q6A555 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms