Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG9BQ674R7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG9BQ674R7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms