Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DENND4CQ5VZ89 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DENND4CQ5VZ89 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms