Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM46CQ5VWP2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM46CQ5VWP2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms