Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVQ6

YOD1, Ubiquitin thioesterase OTU1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YOD1Q5VVQ6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YOD1Q5VVQ6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms