Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf135Q5VTT2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms