Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRAMEF17Q5VTA0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms