Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIF1Q5UIP0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms