Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CROCCQ5TZA2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms